konsenzuální sekvence (consensus sequence)

charakteristická a relativně konzervovaná sekvence bází DNA společná většímu počtu genů (nebo jejich regulačních oblastí) příbuzných funkcí nebo alespoň vykazujících určitou evoluční homologii. Pojem se analogicky používá také pro RNA a pro bílkoviny (odpovídající sekvence aminokyselin), jde o sekvence přítomné v homologických místech genomu různých druhů nebo na různých místech téhož genomu. Základním rysem k. s. je konzervativní (stálá) přítomnost určitých bází v určitých (relativních) polohách a společná či podobná funkce příslušné bílkoviny nebo její domény. Míra podobnosti dvou k. s. je mírou jejich evoluční příbuznosti, což platí jak pro různé druhy, tak pro různé bílkoviny téhož organismu. Naopak to, že se určité báze, resp. aminokyseliny, vyskytují konstantně na týchž pozicích, obv. vypovídá o jejich biologickém významu (vazba, enzymová reakce). Např. k. s. TATAAAA (tzv. TATA-box) je konstantně přítomná v promotorové oblasti genů u eukaryont od prvoků po člověka. Nukleární retinoidní receptory (RXR) se vždy vážou na sekvenci AGGTCA, která tak je jejich k. s. Podobně u bílkovin se např. k. s. G-X-S-X-G (glycin-X-serin-X-glycin, kde X může být jakákoli aminokyselina) nachází v aktivním místě mnoha hydroláz (esteráz, lipáz, transferáz, lyáz aj.). Syn. souhlasná sekvence, konvenční sekvence

« Zpět

Oborové lexikony